Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms