Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Abcc8B2RUS7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Abcc8B2RUS7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Abcc8B2RUS7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Abcc8B2RUS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms