Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrt4B2RU40 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrt4B2RU40 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms