Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc22a28B2RT89 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms