Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ythdc2B2RR83 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ythdc2B2RR83 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ythdc2B2RR83 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms