Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1B2KF50 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms