Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brpf3B2KF05 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms