Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CK137956B1AYM9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CK137956B1AYM9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms