Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nfx1B1AY10 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfx1B1AY10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfx1B1AY10 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms