Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scml2B1AVB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms