Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik3B1AS29 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik3B1AS29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms