Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem238A9JSM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem238A9JSM3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms