Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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H2-M5A7VMS3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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H2-M5A7VMS3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M5A7VMS3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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