Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930435E12RikA6X8Z9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms