Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss40A6H6T1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss40A6H6T1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms