Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc9bA3KGF9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms