Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a4A2AX52 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms