Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtcflA2APF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms