Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c4A2ANA3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c4A2ANA3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms