Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabreA2AMW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabreA2AMW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms