Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SetxA2AKX3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SetxA2AKX3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms