Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm12A2AJ77 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms