Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm11A2AGX3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prdm11A2AGX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm11A2AGX3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm11A2AGX3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm11A2AGX3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm11A2AGX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm11A2AGX3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms