Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc163A2AGD7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms