Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2dnl1A2AFH1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2dnl1A2AFH1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms