Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyb561d1A2AE42 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms