Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm884A2A9H6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms