Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprfA2A8L5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprfA2A8L5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms