Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb4A2A863 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms