Protein–RNA interactions for Protein: A2A654

Bptf, Bromodomain PHD finger transcription factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BptfA2A654 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BptfA2A654 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BptfA2A654 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BptfA2A654 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BptfA2A654 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BptfA2A654 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BptfA2A654 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BptfA2A654 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BptfA2A654 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms