Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms