Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms