Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms