Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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