Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv31A0A075B5J5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv31A0A075B5J5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms