Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrit3W8DXL4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms