Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Speer3W4VSP1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Speer3W4VSP1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms