Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd2V9GX34 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms