Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm26992S4R1A3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms