Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc166S4R181 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc166S4R181 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms