Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hdac5Q9Z2V6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Hdac5Q9Z2V6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms