Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms