Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd1Q9Z2E2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mbd1Q9Z2E2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms