Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc45Q9Z1X9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc45Q9Z1X9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms