Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clic1Q9Z1Q5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clic1Q9Z1Q5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clic1Q9Z1Q5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clic1Q9Z1Q5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms