Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne6Q9Z140 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms