Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf15Q9Z0J7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms