Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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AireQ9Z0E3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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