Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmfbp1Q9WVQ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms