Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin2Q9WVE8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms